Plotting fails on a fresh MacOS install

New to Julia
1

Just installed the latest version of Julia, then tried running a small example found on a forum post in here:

using Plots; pyplot()
x=range(-2,stop=2,length=100)
y=range(sqrt(2),stop=2,length=100)
f(x,y) = x*y-x-y+1
plot(x,y,f,st=:surface,camera=(-30,30))

and it fails with the following errors. Any idea?

[ 1 ] alexandre@Alexandres-MacBook-Pro Desktop ./test.jl
[ Info: Installing matplotlib via the Conda matplotlib package...
[ Info: Running `conda install -y matplotlib` in root environment
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /Users/alexandre/.julia/conda/3

  added / updated specs:
    - matplotlib


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    cycler-0.10.0              |   py39hecd8cb5_0          16 KB
    freetype-2.10.4            |       ha233b18_0         564 KB
    giflib-5.2.1               |       haf1e3a3_0          70 KB
    jpeg-9d                    |       h9ed2024_0         215 KB
    kiwisolver-1.3.1           |   py39h23ab428_0          53 KB
    lcms2-2.12                 |       hf1fd2bf_0         284 KB
    libpng-1.6.37              |       ha441bb4_0         262 KB
    libtiff-4.2.0              |       h87d7836_0         462 KB
    libwebp-1.2.0              |       hacca55c_0         441 KB
    libwebp-base-1.2.0         |       h9ed2024_0         389 KB
    lz4-c-1.9.3                |       h23ab428_1         140 KB
    matplotlib-3.3.4           |   py39hecd8cb5_0          26 KB
    matplotlib-base-3.3.4      |   py39h8b3ea08_0         5.1 MB
    olefile-0.46               |     pyhd3eb1b0_0          34 KB
    pillow-8.4.0               |   py39h98e4679_0         610 KB
    pyparsing-2.4.7            |     pyhd3eb1b0_0          59 KB
    python-dateutil-2.8.2      |     pyhd3eb1b0_0         233 KB
    tornado-6.1                |   py39h9ed2024_0         587 KB
    zstd-1.4.9                 |       h322a384_0         476 KB
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:         9.9 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  cycler             pkgs/main/osx-64::cycler-0.10.0-py39hecd8cb5_0
  freetype           pkgs/main/osx-64::freetype-2.10.4-ha233b18_0
  giflib             pkgs/main/osx-64::giflib-5.2.1-haf1e3a3_0
  jpeg               pkgs/main/osx-64::jpeg-9d-h9ed2024_0
  kiwisolver         pkgs/main/osx-64::kiwisolver-1.3.1-py39h23ab428_0
  lcms2              pkgs/main/osx-64::lcms2-2.12-hf1fd2bf_0
  libpng             pkgs/main/osx-64::libpng-1.6.37-ha441bb4_0
  libtiff            pkgs/main/osx-64::libtiff-4.2.0-h87d7836_0
  libwebp            pkgs/main/osx-64::libwebp-1.2.0-hacca55c_0
  libwebp-base       pkgs/main/osx-64::libwebp-base-1.2.0-h9ed2024_0
  lz4-c              pkgs/main/osx-64::lz4-c-1.9.3-h23ab428_1
  matplotlib         pkgs/main/osx-64::matplotlib-3.3.4-py39hecd8cb5_0
  matplotlib-base    pkgs/main/osx-64::matplotlib-base-3.3.4-py39h8b3ea08_0
  olefile            pkgs/main/noarch::olefile-0.46-pyhd3eb1b0_0
  pillow             pkgs/main/osx-64::pillow-8.4.0-py39h98e4679_0
  pyparsing          pkgs/main/noarch::pyparsing-2.4.7-pyhd3eb1b0_0
  python-dateutil    pkgs/main/noarch::python-dateutil-2.8.2-pyhd3eb1b0_0
  tornado            pkgs/main/osx-64::tornado-6.1-py39h9ed2024_0
  zstd               pkgs/main/osx-64::zstd-1.4.9-h322a384_0



Downloading and Extracting Packages
giflib-5.2.1         | 70 KB     | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
matplotlib-base-3.3. | 5.1 MB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
libwebp-1.2.0        | 441 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
jpeg-9d              | 215 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
matplotlib-3.3.4     | 26 KB     | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
pyparsing-2.4.7      | 59 KB     | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
libpng-1.6.37        | 262 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
lcms2-2.12           | 284 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
kiwisolver-1.3.1     | 53 KB     | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
freetype-2.10.4      | 564 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
libwebp-base-1.2.0   | 389 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
libtiff-4.2.0        | 462 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
lz4-c-1.9.3          | 140 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
pillow-8.4.0         | 610 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
tornado-6.1          | 587 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
python-dateutil-2.8. | 233 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
zstd-1.4.9           | 476 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
cycler-0.10.0        | 16 KB     | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
olefile-0.46         | 34 KB     | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
[ Info: Installing pyqt package to avoid buggy tkagg backend.
[ Info: Installing PyQt5 via the Conda pyqt package...
[ Info: Running `conda install -y pyqt` in root environment
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done

## Package Plan ##

  environment location: /Users/alexandre/.julia/conda/3

  added / updated specs:
    - pyqt


The following packages will be downloaded:

    package                    |            build
    ---------------------------|-----------------
    icu-58.2                   |       h0a44026_3        10.1 MB
    pyqt-5.9.2                 |   py39h23ab428_6         3.7 MB
    qt-5.9.7                   |       h468cd18_1        62.0 MB
    sip-4.19.13                |   py39h23ab428_0         243 KB
    ------------------------------------------------------------
                                           Total:        76.1 MB

The following NEW packages will be INSTALLED:

  icu                pkgs/main/osx-64::icu-58.2-h0a44026_3
  pyqt               pkgs/main/osx-64::pyqt-5.9.2-py39h23ab428_6
  qt                 pkgs/main/osx-64::qt-5.9.7-h468cd18_1
  sip                pkgs/main/osx-64::sip-4.19.13-py39h23ab428_0



Downloading and Extracting Packages
pyqt-5.9.2           | 3.7 MB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
sip-4.19.13          | 243 KB    | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
icu-58.2             | 10.1 MB   | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
qt-5.9.7             | 62.0 MB   | ##################################################################################################################################################################################################################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
┌ Warning: No working GUI backend found for matplotlib
└ @ PyPlot ~/.julia/packages/PyPlot/XaELc/src/init.jl:165
┌ Warning: You are using Matplotlib 3.3.4, which is no longer
│ officialy supported by the Plots community. To ensure smooth Plots.jl
│ integration update your Matplotlib library to a version >= 3.4.0
│
│ If you have used Conda.jl to install PyPlot (default installation),
│ upgrade your matplotlib via Conda.jl and rebuild the PyPlot.
│
│ If you are not sure, here are the default instructions:
│
│ In Julia REPL:
│ ```
│ import Pkg;
│ Pkg.add("Conda")
│ import Conda
│ Conda.update()
│ Pkg.build("PyPlot")
│ ```
│
└ @ Plots ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/backends/pyplot.jl:29
ERROR: LoadError: PyError ($(Expr(:escape, :(ccall(#= /Users/alexandre/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:43 =# @pysym(:PyObject_Call), PyPtr, (PyPtr, PyPtr, PyPtr), o, pyargsptr, kw))))) <class 'AttributeError'>
AttributeError("'Text' object has no property 'math_fontfamily'")
  File "/Users/alexandre/.julia/conda/3/lib/python3.9/site-packages/matplotlib/colorbar.py", line 761, in set_label
    self._set_label()
  File "/Users/alexandre/.julia/conda/3/lib/python3.9/site-packages/matplotlib/colorbar.py", line 731, in _set_label
    self.ax.set_ylabel(self._label, **self._labelkw)
  File "/Users/alexandre/.julia/conda/3/lib/python3.9/site-packages/matplotlib/axes/_axes.py", line 300, in set_ylabel
    return self.yaxis.set_label_text(ylabel, fontdict, **kwargs)
  File "/Users/alexandre/.julia/conda/3/lib/python3.9/site-packages/matplotlib/axis.py", line 1566, in set_label_text
    self.label.update(kwargs)
  File "/Users/alexandre/.julia/conda/3/lib/python3.9/site-packages/matplotlib/text.py", line 179, in update
    super().update(kwargs)
  File "/Users/alexandre/.julia/conda/3/lib/python3.9/site-packages/matplotlib/artist.py", line 996, in update
    raise AttributeError(f"{type(self).__name__!r} object "

Stacktrace:
  [1] pyerr_check
    @ ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/exception.jl:62 [inlined]
  [2] pyerr_check
    @ ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/exception.jl:66 [inlined]
  [3] _handle_error(msg::String)
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/exception.jl:83
  [4] macro expansion
    @ ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/exception.jl:97 [inlined]
  [5] #107
    @ ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:43 [inlined]
  [6] disable_sigint
    @ ./c.jl:458 [inlined]
  [7] __pycall!
    @ ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:42 [inlined]
  [8] _pycall!(ret::PyCall.PyObject, o::PyCall.PyObject, args::Tuple{String}, nargs::Int64, kw::PyCall.PyObject)
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:29
  [9] _pycall!(ret::PyCall.PyObject, o::PyCall.PyObject, args::Tuple{String}, kwargs::Base.Iterators.Pairs{Symbol, Any, NTuple{4, Symbol}, NamedTuple{(:size, :family, :math_fontfamily, :color), Tuple{Int64, String, String, NTuple{4, FixedPointNumbers.N0f8}}}})
    @ PyCall ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:11
 [10] #_#114
    @ ~/.julia/packages/PyCall/BD546/src/pyfncall.jl:86 [inlined]
 [11] _before_layout_calcs(plt::Plots.Plot{Plots.PyPlotBackend})
    @ Plots ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/backends/pyplot.jl:1155
 [12] prepare_output(plt::Plots.Plot{Plots.PyPlotBackend})
    @ Plots ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/plot.jl:217
 [13] show
    @ ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/output.jl:212 [inlined]
 [14] pdf(plt::Plots.Plot{Plots.PyPlotBackend}, fn::String)
    @ Plots ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/output.jl:23
 [15] savefig(plt::Plots.Plot{Plots.PyPlotBackend}, fn::String)
    @ Plots ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/output.jl:123
 [16] savefig(fn::String)
    @ Plots ~/.julia/packages/Plots/vFFCj/src/output.jl:128
 [17] top-level scope
    @ ~/Desktop/test.jl:9
in expression starting at /Users/alexandre/Desktop/test.jl:9
[ 1 ] alexandre@Alexandres-MacBook-Pro Desktop
2

For others having the same issue, found a solution:

In Julia REPL,

import Pkg;
Pkg.add("Conda")
import Conda
Conda.update()
Pkg.build("PyPlot")

No idea why was that necessary but the code now works. Though I’m still getting a warning, no idea if there’s any consequence.

[ 1 ] alexandre@Alexandres-MacBook-Pro Desktop ./test.jl
[ Info: Installing pyqt package to avoid buggy tkagg backend.
┌ Warning: No working GUI backend found for matplotlib
└ @ PyPlot ~/.julia/packages/PyPlot/XaELc/src/init.jl:165
3

I was having the same problem and getting the same warning about using Matplotlib 3.3.4. Fix required re-building PyCall after setting ENV[“PYTHON”]=“… to appropriate python or venv…” that has an updated or appropriate matplotlib version. After that, PyPlot was fine. PyPlot uses PyCall so re-building PyPlot did not help in that case.

4

Conda/pip doesn’t try to fetch the newest pkg, the strategy is “whatever works”. And it looks like a manual Conda.update() from Julia’s side solves the issue.